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可见，纯化水的水质是非常高的，那么它的制备流程也是比较复杂的。从一开始的原水，达到真正意义上的纯化水，要历经以下工艺流程的蜕变：
原水——原水加压泵——多介质过滤——活性炭过滤——软水——精密过滤——一级反渗透——PH调节——中间水箱——二级反渗透——纯化水箱——纯水泵——紫外线消毒杀菌器——微孔过滤——纯化水用水点。
在《中国药典2010版标准》中，纯化水、注射用水、灭菌注射用水这些水的水质要求是非常高的，都是要求进行适当的灭菌和消毒可以使用的，这就意味着纯化水消毒系统有极高的地位。从以上纯化水的制备流程我们也可以看到，紫外线消毒杀菌工作是作为一大核心消毒工艺的。
因为在纯化水中，使用紫外线消毒器进行杀菌消毒的原因，主要是由于它的杀菌范围是目前已知的所有消毒工艺中最广的一种杀菌方法。因为在目前看来，水中存在有耐高温细菌、耐低温细菌、也有耐药性很强的细菌，但还没有发现可以耐紫外线的细菌存在。而紫外线消毒器不仅拥有最广的杀菌范围，还具备经济实惠、快速作用、使用简便、安全环保等特点，因而该设备在纯化水制备领域的使用非常普遍。
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